Em junho de 1998 sucedeu o então bispo de Faisalabad, dom John Joseph e continuou o trabalho de seu antecessor, exigindo a libertação dos cristãos presos pela lei anti-blasfêmia. Desempenhou um papel fundamental na luta pelos direitos dos cristãos e para melhorar os cuidados de saúde, educação, habitação e bem-estar desta parte da população.
O diálogo inter-religioso é a principal preocupação de Dom Joseph Coutts. O diálogo é a melhor arma para eliminar divisões entre cristãos e muçulmanos, estes que representam 95% da população. Mas a lei contra a blasfêmia é um obstáculo aparentemente intransponível. Os focos de violência podem ocorrer a qualquer momento, "porque ninguém tem tempo para perguntar se as acusações são verdadeiras: a justiça não segue seu curso", disse o bispo Coutts.
Ele disse que o problema da lei contra a blasfêmia tem aumentado dramaticamente a partir de 2001, na sequência de um crescente sentimento anti-ocidental no Paquistão, atingindo seu pico durante a intervenção dos EUA no Iraque e no Afeganistão.
Se o bispo Coutts é um pai para seu povo vivendo na sombra da violência e da opressão, também é objeto de ameaças de morte. Mas ele se recusa a ser intimidado: "não vamos ser aterrorizados por intimidação. Vamos continuar nossas atividades no interesse da harmonia e da paz no país ", disse.
"Ao longo dos anos temos assistido a um aumento gradual de intolerância em relação aos não-muçulmanos. Nós vivemos em um estado de tensão constante, mas mesmo em nosso sofrimento, somos testemunhas de Cristo", disse o bispo Coutts, quando falou aos amigos e benfeitores da Ajuda à Igreja que Sofre.
O trabalho do bispo Coutts lhe rendeu muitos elogios de todos os cantos do mundo. Em 2007, ele recebeu na Alemanha, o premio Shalom da Universidade Católica de Eichstätt-Ingolstadt.
Ao recordar os seus esforços, muitas vezes arriscados, para defender os cristãos do Paquistão, o bispo lembra a importância da oração: "que as pessoas ao redor do mundo orem por nós, isto significa muito. Isso nos lembra que não estamos sozinhos e nos dá força para continuar", disse ele à AIS.
